Lanthanum in the structure of Solution Structure of GB1 With Lbt Probe (pdb 2rpv)

The binding sites of Lanthanum atom in the structure of Solution Structure of GB1 With Lbt Probe (pdb code 2rpv). This binding sites where shown with 5.0 Angstroms radius around Lanthanum atom. The 2rpv structure was solved by T.SAIO, K.OGURA, M.YOKOCHI, Y.KOBASHIGAWA, F.INAGAKI, with NMR in Solution technique. Lanthanum Binding Sites: Lanthanum binding site 1 out of 1 in 2rpv Click to enlarge Click to enlarge Mono- and Stereo- picture of 5.0 Angstrom coordination sphere 1 of Lanthanum in the PDB 2rpv. Coordination sphere was calculated for all residues within 5.0 Angstroms distance from the central Lanthanum atom, shown by VdW sphere Residues shown as a stick model or VDW spheres: A: Asp4, A: Thr5, A: Asn6, A: Asn7, A: Asp8, A: Ala10, A: Tyr11, A: Glu12, A: Glu15, A: Asp4, A: Thr5, A: Asn6, A: Asn7, A: Asp8, A: Gly9, A: Ala10, A: Tyr11, A: Glu12, A: Glu15, A: Asp4, A: Thr5, A: Asn6, A: Asn7, A: Asp8, A: Gly9, A: Ala10, A: Tyr11, A: Glu12, A: Glu15, A: Asp4, A: Thr5, A: Asn6, A: Asn7, A: Asp8, A: Gly9, A: Ala10, A: Tyr11, A: Glu12, A: Glu15, A: Asp4, A: Thr5, A: Asn6, A: Asn7, A: Asp8, A: Gly9, A: Ala10, A: Tyr11, A: Glu12, A: Glu15, A: Asp4, A: Thr5, A: Asn6, A: Asn7, A: Asp8, A: Gly9, A: Ala10, A: Tyr11, A: Glu12, A: Glu15, A: Asp4, A: Thr5, A: Asn6, A: Asn7, A: Asp8, A: Gly9, A: Ala10, A: Tyr11, A: Glu12, A: Glu15, A: Asp4, A: Thr5, A: Asn6, A: Asn7, A: Asp8, A: Gly9, A: Ala10, A: Tyr11, A: Glu12, A: Glu15, A: Asp4, A: Thr5, A: Asn6, A: Asp8, A: Gly9, A: Ala10, A: Tyr11, A: Glu12, A: Glu15, A: Asp4, A: Thr5, A: Asn6, A: Asn7, A: Asp8, A: Gly9, A: Ala10, A: Tyr11, A: Glu12, A: Glu15, A: Asp4, A: Thr5, A: Asn6, A: Asn7, A: Asp8, A: Gly9, A: Ala10, A: Tyr11, A: Glu12, A: Glu15, A: Asp4, A: Thr5, A: Asn6, A: Asn7, A: Asp8, A: Gly9, A: Ala10, A: Tyr11, A: Glu12, A: Glu15, A: Asp4, A: Thr5, A: Asn6, A: Asn7, A: Asp8, A: Gly9, A: Ala10, A: Tyr11, A: Glu12, A: Glu15, A: Asp4, A: Thr5, A: Asn6, A: Asn7, A: Asp8, A: Ala10, A: Tyr11, A: Glu12, A: Glu15, A: Asp4, A: Thr5, A: Asn6, A: Asp8, A: Gly9, A: Ala10, A: Tyr11, A: Glu12, A: Glu15, A: Asp4, A: Thr5, A: Asn6, A: Asn7, A: Asp8, A: Gly9, A: Ala10, A: Tyr11, A: Glu12, A: Glu15, A: Asp4, A: Thr5, A: Asn6, A: Asn7, A: Asp8, A: Gly9, A: Ala10, A: Tyr11, A: Glu12, A: Glu15, A: Asp4, A: Thr5, A: Asn6, A: Asn7, A: Asp8, A: Gly9, A: Ala10, A: Tyr11, A: Glu12, A: Glu15, A: Asp4, A: Thr5, A: Asn6, A: Asp8, A: Gly9, A: Ala10, A: Tyr11, A: Glu12, A: Glu15, A: Asp4, A: Thr5, A: Asn6, A: Asp8, A: Ala10, A: Tyr11, A: Glu12, A: Glu15, conact list: Atom Atom Distance (A) La O A:Asp4 4.98 La HB2 A:Asp4 3.15 La N A:Asp4 4.92 La CB A:Asp4 2.88 La HB3 A:Asp4 3.66 La HA A:Asp4 3.36 La OD2 A:Asp4 1.84 La OD1 A:Asp4 1.32 La C A:Asp4 4.00 La CG A:Asp4 1.55 La CA A:Asp4 3.56 La N A:Thr5 3.80 La C A:Thr5 4.64 La HG1 A:Thr5 4.67 La CA A:Thr5 4.85 La H A:Thr5 3.31 La HB2 A:Asn6 2.78 La HD21 A:Asn6 4.60 La N A:Asn6 3.61 La CB A:Asn6 3.32 La HD22 A:Asn6 4.29 La HB3 A:Asn6 4.25 La ND2 A:Asn6 3.95 La OD1 A:Asn6 2.50 La C A:Asn6 4.63 La CG A:Asn6 2.98 La CA A:Asn6 4.02 La HA A:Asn6 4.94 La H A:Asn6 2.81 La N A:Asn7 4.36 La H A:Asn7 3.74 La N A:Asp8 4.47 La CB A:Asp8 4.61 La HB3 A:Asp8 4.92 La OD2 A:Asp8 3.02 La H A:Asp8 3.50 La OD1 A:Asp8 3.13 La CG A:Asp8 3.30 La O A:Ala10 2.66 La HB2 A:Ala10 4.50 La N A:Ala10 4.50 La H A:Ala10 3.63 La C A:Ala10 3.88 La CA A:Ala10 4.70 La N A:Tyr11 4.86 La CA A:Tyr11 4.93 La HA A:Tyr11 4.09 La OE1 A:Glu12 3.42 La OE2 A:Glu12 3.24 La CD A:Glu12 3.69 La H A:Glu12 4.38 La HB2 A:Glu15 4.79 La OE1 A:Glu15 2.38 La HG3 A:Glu15 4.68 La CB A:Glu15 4.79 La HB3 A:Glu15 4.68 La OE2 A:Glu15 2.42 La CD A:Glu15 2.59 La CG A:Glu15 3.99 La HG2 A:Glu15 4.16 La O A:Asp4 4.98 La HB2 A:Asp4 3.15 La N A:Asp4 4.92 La CB A:Asp4 2.88 La HB3 A:Asp4 3.66 La HA A:Asp4 3.36 La OD2 A:Asp4 1.84 La OD1 A:Asp4 1.32 La C A:Asp4 4.00 La CG A:Asp4 1.55 La CA A:Asp4 3.56 La N A:Thr5 3.80 La C A:Thr5 4.64 La HG1 A:Thr5 4.67 La CA A:Thr5 4.85 La H A:Thr5 3.31 La HB2 A:Asn6 2.78 La HD21 A:Asn6 4.60 La N A:Asn6 3.61 La CB A:Asn6 3.32 La HD22 A:Asn6 4.29 La HB3 A:Asn6 4.25 La ND2 A:Asn6 3.95 La OD1 A:Asn6 2.50 La C A:Asn6 4.63 La CG A:Asn6 2.98 La CA A:Asn6 4.02 La HA A:Asn6 4.94 La H A:Asn6 2.81 La N A:Asn7 4.36 La H A:Asn7 3.74 La N A:Asp8 4.47 La CB A:Asp8 4.61 La HB3 A:Asp8 4.92 La OD2 A:Asp8 3.02 La H A:Asp8 3.50 La OD1 A:Asp8 3.13 La CG A:Asp8 3.30 La O A:Ala10 2.66 La HB2 A:Ala10 4.50 La N A:Ala10 4.50 La H A:Ala10 3.63 La C A:Ala10 3.88 La CA A:Ala10 4.70 La N A:Tyr11 4.86 La CA A:Tyr11 4.93 La HA A:Tyr11 4.09 La OE1 A:Glu12 3.42 La OE2 A:Glu12 3.24 La CD A:Glu12 3.69 La H A:Glu12 4.38 La HB2 A:Glu15 4.79 La OE1 A:Glu15 2.38 La HG3 A:Glu15 4.68 La CB A:Glu15 4.79 La HB3 A:Glu15 4.68 La OE2 A:Glu15 2.42 La CD A:Glu15 2.59 La CG A:Glu15 3.99 La HG2 A:Glu15 4.16 La O A:Asp4 4.98 La HB2 A:Asp4 3.15 La N A:Asp4 4.92 La CB A:Asp4 2.88 La HB3 A:Asp4 3.66 La HA A:Asp4 3.36 La OD2 A:Asp4 1.84 La OD1 A:Asp4 1.32 La C A:Asp4 4.00 La CG A:Asp4 1.55 La CA A:Asp4 3.56 La N A:Thr5 3.80 La C A:Thr5 4.64 La HG1 A:Thr5 4.67 La CA A:Thr5 4.85 La H A:Thr5 3.31 La HB2 A:Asn6 2.78 La HD21 A:Asn6 4.60 La N A:Asn6 3.61 La CB A:Asn6 3.32 La HD22 A:Asn6 4.29 La HB3 A:Asn6 4.25 La ND2 A:Asn6 3.95 La OD1 A:Asn6 2.50 La C A:Asn6 4.63 La CG A:Asn6 2.98 La CA A:Asn6 4.02 La HA A:Asn6 4.94 La H A:Asn6 2.81 La N A:Asn7 4.36 La H A:Asn7 3.74 La N A:Asp8 4.47 La CB A:Asp8 4.61 La HB3 A:Asp8 4.92 La OD2 A:Asp8 3.02 La H A:Asp8 3.50 La OD1 A:Asp8 3.13 La CG A:Asp8 3.30 La O A:Ala10 2.66 La HB2 A:Ala10 4.50 La N A:Ala10 4.50 La H A:Ala10 3.63 La C A:Ala10 3.88 La CA A:Ala10 4.70 La N A:Tyr11 4.86 La CA A:Tyr11 4.93 La HA A:Tyr11 4.09 La OE1 A:Glu12 3.42 La OE2 A:Glu12 3.24 La CD A:Glu12 3.69 La H A:Glu12 4.38 La HB2 A:Glu15 4.79 La OE1 A:Glu15 2.38 La HG3 A:Glu15 4.68 La CB A:Glu15 4.79 La HB3 A:Glu15 4.68 La OE2 A:Glu15 2.42 La CD A:Glu15 2.59 La CG A:Glu15 3.99 La HG2 A:Glu15 4.16 La O A:Asp4 4.98 La HB2 A:Asp4 3.15 La N A:Asp4 4.92 La CB A:Asp4 2.88 La HB3 A:Asp4 3.66 La HA A:Asp4 3.36 La OD2 A:Asp4 1.84 La OD1 A:Asp4 1.32 La C A:Asp4 4.00 La CG A:Asp4 1.55 La CA A:Asp4 3.56 La N A:Thr5 3.80 La C A:Thr5 4.64 La HG1 A:Thr5 4.67 La CA A:Thr5 4.85 La H A:Thr5 3.31 La HB2 A:Asn6 2.78 La HD21 A:Asn6 4.60 La N A:Asn6 3.61 La CB A:Asn6 3.32 La HD22 A:Asn6 4.29 La HB3 A:Asn6 4.25 La ND2 A:Asn6 3.95 La OD1 A:Asn6 2.50 La C A:Asn6 4.63 La CG A:Asn6 2.98 La CA A:Asn6 4.02 La HA A:Asn6 4.94 La H A:Asn6 2.81 La N A:Asn7 4.36 La H A:Asn7 3.74 La N A:Asp8 4.47 La CB A:Asp8 4.61 La HB3 A:Asp8 4.92 La OD2 A:Asp8 3.02 La H A:Asp8 3.50 La OD1 A:Asp8 3.13 La CG A:Asp8 3.30 La O A:Ala10 2.66 La HB2 A:Ala10 4.50 La N A:Ala10 4.50 La H A:Ala10 3.63 La C A:Ala10 3.88 La CA A:Ala10 4.70 La N A:Tyr11 4.86 La CA A:Tyr11 4.93 La HA A:Tyr11 4.09 La OE1 A:Glu12 3.42 La OE2 A:Glu12 3.24 La CD A:Glu12 3.69 La H A:Glu12 4.38 La HB2 A:Glu15 4.79 La OE1 A:Glu15 2.38 La HG3 A:Glu15 4.68 La CB A:Glu15 4.79 La HB3 A:Glu15 4.68 La OE2 A:Glu15 2.42 La CD A:Glu15 2.59 La CG A:Glu15 3.99 La HG2 A:Glu15 4.16 La O A:Asp4 4.98 La HB2 A:Asp4 3.15 La N A:Asp4 4.92 La CB A:Asp4 2.88 La HB3 A:Asp4 3.66 La HA A:Asp4 3.36 La OD2 A:Asp4 1.84 La OD1 A:Asp4 1.32 La C A:Asp4 4.00 La CG A:Asp4 1.55 La CA A:Asp4 3.56 La N A:Thr5 3.80 La C A:Thr5 4.64 La HG1 A:Thr5 4.67 La CA A:Thr5 4.85 La H A:Thr5 3.31 La HB2 A:Asn6 2.78 La HD21 A:Asn6 4.60 La N A:Asn6 3.61 La CB A:Asn6 3.32 La HD22 A:Asn6 4.29 La HB3 A:Asn6 4.25 La ND2 A:Asn6 3.95 La OD1 A:Asn6 2.50 La C A:Asn6 4.63 La CG A:Asn6 2.98 La CA A:Asn6 4.02 La HA A:Asn6 4.94 La H A:Asn6 2.81 La N A:Asn7 4.36 La H A:Asn7 3.74 La N A:Asp8 4.47 La CB A:Asp8 4.61 La HB3 A:Asp8 4.92 La OD2 A:Asp8 3.02 La H A:Asp8 3.50 La OD1 A:Asp8 3.13 La CG A:Asp8 3.30 La O A:Ala10 2.66 La HB2 A:Ala10 4.50 La N A:Ala10 4.50 La H A:Ala10 3.63 La C A:Ala10 3.88 La CA A:Ala10 4.70 La N A:Tyr11 4.86 La CA A:Tyr11 4.93 La HA A:Tyr11 4.09 La OE1 A:Glu12 3.42 La OE2 A:Glu12 3.24 La CD A:Glu12 3.69 La H A:Glu12 4.38 La HB2 A:Glu15 4.79 La OE1 A:Glu15 2.38 La HG3 A:Glu15 4.68 La CB A:Glu15 4.79 La HB3 A:Glu15 4.68 La OE2 A:Glu15 2.42 La CD A:Glu15 2.59 La CG A:Glu15 3.99 La HG2 A:Glu15 4.16 La O A:Asp4 4.98 La HB2 A:Asp4 3.15 La N A:Asp4 4.92 La CB A:Asp4 2.88 La HB3 A:Asp4 3.66 La HA A:Asp4 3.36 La OD2 A:Asp4 1.84 La OD1 A:Asp4 1.32 La C A:Asp4 4.00 La CG A:Asp4 1.55 La CA A:Asp4 3.56 La N A:Thr5 3.80 La C A:Thr5 4.64 La HG1 A:Thr5 4.67 La CA A:Thr5 4.85 La H A:Thr5 3.31 La HB2 A:Asn6 2.78 La HD21 A:Asn6 4.60 La N A:Asn6 3.61 La CB A:Asn6 3.32 La HD22 A:Asn6 4.29 La HB3 A:Asn6 4.25 La ND2 A:Asn6 3.95 La OD1 A:Asn6 2.50 La C A:Asn6 4.63 La CG A:Asn6 2.98 La CA A:Asn6 4.02 La HA A:Asn6 4.94 La H A:Asn6 2.81 La N A:Asn7 4.36 La H A:Asn7 3.74 La N A:Asp8 4.47 La CB A:Asp8 4.61 La HB3 A:Asp8 4.92 La OD2 A:Asp8 3.02 La H A:Asp8 3.50 La OD1 A:Asp8 3.13 La CG A:Asp8 3.30 La O A:Ala10 2.66 La HB2 A:Ala10 4.50 La N A:Ala10 4.50 La H A:Ala10 3.63 La C A:Ala10 3.88 La CA A:Ala10 4.70 La N A:Tyr11 4.86 La CA A:Tyr11 4.93 La HA A:Tyr11 4.09 La OE1 A:Glu12 3.42 La OE2 A:Glu12 3.24 La CD A:Glu12 3.69 La H A:Glu12 4.38 La HB2 A:Glu15 4.79 La OE1 A:Glu15 2.38 La HG3 A:Glu15 4.68 La CB A:Glu15 4.79 La HB3 A:Glu15 4.68 La OE2 A:Glu15 2.42 La CD A:Glu15 2.59 La CG A:Glu15 3.99 La HG2 A:Glu15 4.16 La O A:Asp4 4.98 La HB2 A:Asp4 3.15 La N A:Asp4 4.92 La CB A:Asp4 2.88 La HB3 A:Asp4 3.66 La HA A:Asp4 3.36 La OD2 A:Asp4 1.84 La OD1 A:Asp4 1.32 La C A:Asp4 4.00 La CG A:Asp4 1.55 La CA A:Asp4 3.56 La N A:Thr5 3.80 La C A:Thr5 4.64 La HG1 A:Thr5 4.67 La CA A:Thr5 4.85 La H A:Thr5 3.31 La HB2 A:Asn6 2.78 La HD21 A:Asn6 4.60 La N A:Asn6 3.61 La CB A:Asn6 3.32 La HD22 A:Asn6 4.29 La HB3 A:Asn6 4.25 La ND2 A:Asn6 3.95 La OD1 A:Asn6 2.50 La C A:Asn6 4.63 La CG A:Asn6 2.98 La CA A:Asn6 4.02 La HA A:Asn6 4.94 La H A:Asn6 2.81 La N A:Asn7 4.36 La H A:Asn7 3.74 La N A:Asp8 4.47 La CB A:Asp8 4.61 La HB3 A:Asp8 4.92 La OD2 A:Asp8 3.02 La H A:Asp8 3.50 La OD1 A:Asp8 3.13 La CG A:Asp8 3.30 La O A:Ala10 2.66 La HB2 A:Ala10 4.50 La N A:Ala10 4.50 La H A:Ala10 3.63 La C A:Ala10 3.88 La CA A:Ala10 4.70 La N A:Tyr11 4.86 La CA A:Tyr11 4.93 La HA A:Tyr11 4.09 La OE1 A:Glu12 3.42 La OE2 A:Glu12 3.24 La CD A:Glu12 3.69 La H A:Glu12 4.38 La HB2 A:Glu15 4.79 La OE1 A:Glu15 2.38 La HG3 A:Glu15 4.68 La CB A:Glu15 4.79 La HB3 A:Glu15 4.68 La OE2 A:Glu15 2.42 La CD A:Glu15 2.59 La CG A:Glu15 3.99 La HG2 A:Glu15 4.16 La O A:Asp4 4.98 La HB2 A:Asp4 3.15 La N A:Asp4 4.92 La CB A:Asp4 2.88 La HB3 A:Asp4 3.66 La HA A:Asp4 3.36 La OD2 A:Asp4 1.84 La OD1 A:Asp4 1.32 La C A:Asp4 4.00 La CG A:Asp4 1.55 La CA A:Asp4 3.56 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